高通量测序数据序列格式规范GB/T35890-2018

GB/T35890-2018是我国针对高通量测序序列数据格式制定的规范标准。它主要包括了以下部分：

1. 序列数据格式描述

该部分定义了高通量测序数据的格式，包括FASTQ、SAM和BAM格式。其中，FASTQ格式包含了序列和质量信息，SAM格式是将序列比对到参考基因组上的结果，而BAM格式是二进制的SAM格式文件。

2. 序列ID命名规则

为了方便数据管理和比对分析，在实际应用中需要对每个序列进行命名。该部分规定了序列命名的格式和内容，以及具体的实现方法。

3. 序列质量控制标准

由于高通量测序数据的质量受多种因素影响，如仪器、试剂和实验条件等，因此需要进行质量控制。该部分定义了常用的质量控制指标和方法，以及其相关的实现细节。

4. 数据存储和传输规范

由于高通量测序数据的文件大小较大，因此在存储和传输过程中需要考虑数据压缩和加密等问题。该部分规定了相应的存储和传输规范，以保证数据的安全性和可靠性。

5. 数据共享和使用规范

作为一种公共资源，高通量测序数据需要进行数据共享和使用。该部分规定了数据共享和使用的原则和方式，以及相应的管理机制。

通过遵循GB/T35890-2018中规定的格式和标准，可以更好地管理和分析高通量测序数据，推动生物信息学的发展和应用。