GB/T40188-2021
畜禽分子标记辅助育种技术规程
Technicalcodeofbreedingpracticewithmolecularmarkerassistedselectionforlivestockandpoultry
- 中国标准分类号（CCS）B43
- 国际标准分类号（ICS）65.020.30
- 实施日期2021-12-01
- 文件格式PDF
- 文本页数7页
- 文件大小443.63KB
以图片形式预览畜禽分子标记辅助育种技术规程
畜禽分子标记辅助育种技术规程
国家标准 GB/T40188一2021 畜禽分子标记辅助育种技术规程 Technicalcodeofbreedingpracticewithmolecularmarkerassisted seleetionforlivestockandpoultry 2021-05-21发布 2021-12-01实施 国家市场监督管理总局 发布 国家标涯花管理委员会国家标准
GB/40188一2021 前 言 本标准按照GB/T1.1一2009给出的规则起草
本标准由标准化研究院提出并归口 本标准起草单位:农业科学院北京畜牧兽医研究所、华中农业大学、标准化研究院
本标准主要起草人:李奎、刘志国、赵书红,朱猛进、吴添文、李新云、牟玉莲、王冰源、马爱进
GB/40188一2021 畜禽分子标记辅助育种技术规程 范围 本标准规定了畜禽分子标记辅助育种的基本要求和操作要求
本标准适用于猪、牛,山羊,绵羊和鸡的分子标记辅助育种,其他动物育种可参考使用
规范性引用文件 下列文件对于本文件的应用是必不可少的
凡是注日期的引用文件,仅注日期的版本适用于本文 件
凡是不注日期的引用文件,其最新版本(包括所有的修改单)适用于本文件 NY/T821猪肌肉品质测定技术规范 NY/T822种猪生产性能测定规程 NY/T825瘦肉型猪桐体性状测定技术规范 828肉鸡生产性能测定技术规范 1236绵、山羊生产性能测定技术规范 1450 荷斯坦牛生产性能测定技术规范 NY/T1673畜禽微卫星DNA遗传多样性检测技术规程 NY/T2123蛋鸡生产性能测定技术规范 NY/T2660肉牛生产性能测定技术规范 转基因动物及其产品成分检测DNA提取和纯化(农业部2406号公告-7-2016 术语和定义 下列术语和定义适用于本文件
3.1 markerassistedselection;MAS 标记辅助选择 利用与目标性状紧密连锁的DNA分子标记对目标性状进行间接选择的育种技术
3.2 标记辅助最佳线性无偏预测 markerassistedbestlinearmbiasedpredietiom;MA-BLU 适用于畜禽MAs的一种混合线性模型方法,该混合线性模型将个体育种值剖分为前景分子标记 效应与背景微效多基因效应两部分,通过混合模型方程组(MME)同时求解分子标记效应与微效多基因 效应,畜禽个体估计育种值为分子标记效应和微效多基因效应之和
3.3 分子净值 netmolecularscOre 在畜禽MAs的选择指数中,由分子标记效应值构成的部分,本质为与分子标记相关的所有数量性 状基因座(quantitativetraitlocus,QTL)加性效应的总和
选择指数seleetionindex 畜禽MAs的一种方法,由分子净值与个体表型值的离差值两部分加权合并而成
GB/T40188一2021 基本要求 4.1标记辅助选择的适用范围和条件应满足以下基本要求 a 已知目标性状的主效基因或与之紧密连锁的标记,且分型标记来自主基因内部或与之紧密连 锁的侧翼标记 b 单基因或寡基因的标记辅助选择主要适用于质量性状、闵性状(如疾病性状)以及数量性状已 知主基因或大效应位点的情形 多基因标记辅助选择的适用对象主要为数量性状或多闯性状(如猪的产仔数); c 多基因标记辅助选择应已知目标性状的若干位点或关联标记,宜利用少量标记 d 分子标记类型一般是单核苷酸多态性
e 4.2标记辅助选择的实施单位或委托单位应具备样品采集、运输、标识和储存,表型测定与采集,基因 分型的试验条件和技术人员,确保表型,基因分型数据的完整性和可追溯性
4.3标记辅助选择由一系列程序或活动组成,包括生物样品采样、DNA提取和纯化、,DNA定量分析、 基因分型、分子标记或与分子标记连锁QTL的基因型(或基因型组合)的判定、个体育种值/选择指数 评估、目标个体的保留与淘汰等环节
5 操作要求 5.1采样 5.1.1样品可以是组织样血液样,也可以是可提取DNA的生物学样品， 样品采集需婆避免个体间DNA交叉污染,每个个体的样工具需要更换或请洗 5.1.2 5.1.3样品采集后应怜冻保存
5.1.4采样时,需要填写采样人、采样地点、采样日期、被采个体耳号(或其他有效记录个体身份的编 号)、样品编号等,并妥善保存采集样本照片以及相关记录
5.2DA提取与纯化 按照NY/T1673以及《转基因动物及其产品成分检测DNA提取和纯化》中的规定执行
5.3基因分型 5.3.1基因或标记位点的选择 应符合孟德尔遗传定律,且具有多态性,宜选择经过验证的基因或标记
5.3.2分型 单基因标记可采用基于PCR扩增产物的相关方法判读基因型(如PCR-RFLP,PCR-ssCP等)
多 基因标记可采用分别针对每个标记分型的策略,亦可采用适合多基因标记分型的其他方法开展基因分 型(如小型芯片、,Sequenom等)
5.4表型测定 5.4.1适用范围 单基因标记辅助选择无需进行表型测定,寡基因和多基因标记辅助选择宜进行表型测定以增加选 择的准确性
GB/40188一2021 5.4.2猪的表型测定 5.4.2.1猪肌肉品质测定的指标、方法和条件按照NY/T821规定执行
5.4.2.2种猪生产性能测定的基本条件,受测猪的选择,测定项目、方法及结果的评定方法按照 NY/T822规定执行
5.4.2.3瘦肉型猪胭体性状测定的方法按照NY/T825规定执行
5.4.3牛的表型测定 5.4.3.1荷斯坦牛生产性能测定内容、操作步骤和要求按照NY/T1450规定执行
5.4.3.2肉牛主要生产性能测定的性状与方法按照NY/T2660规定执行
5.4.4羊的表型测定 绵羊,山羊生产性能测定拨照NY/T1236规定执行 5.4.5鸡的表型测定 5.4.5.1蛋鸡生产性能测定的基本条件,受测品种的要求,种蛋取样,测定数量和重复数、测定项目,测 定和统计方法、饲养管理条件、饲料要求、记录档案、检验报告等要求按照NY/2123规定执行
5.4.5.2肉种鸡、商品肉鸡生产性能测定的程序、项目和条件按照NY/T828规定执行
5.5标记辅助选择 5.5.1单基因或寡基因的标记辅助选择 5.5.1.1直接选择 直接根据育种群的基因分型结果,淘汰非理想基因型或基因型组合的个体,保留理想基因型或基因 型组合的个体
5.5.1.2两阶段选择法 在直接选择法基础上增加传统遗传评估环节
第一阶段,根据育种群的基因分型结果,保留理想基 因型或基因型组合的个体,淘汰非理想基因型或基因型组合的个体
第二阶段,对保留个体组成的育种 群,实施传统遗传评估,根据目标性状的个体育种值选留优秀亲本
5.5.2多基因标记辅助选择 5.5.2.1选择指数 计算分子净值和表型离差,加权分子净值和表型离差,构建选择指数(参见附录A),根据个体选择 指数的计算值排序,按预设留种率选留优秀亲本
5.5.2.2MA-BLUP 利用MA-BLUP模型(参见附录B)整合系谱,表型和标记信息,估计个体MA-BLUP育种值并排 序,按预设留种率选留优秀亲本
GB/T40188一2021 附 录 A 资料性附录) 选择指数公式及说明 选择指数计算见式(A.1) A.1 I=b之bmn 式中 表型离差在选择指数中所占的权重; b 表型离差; 分子净值在选择指数中所占的权重; b 分子净值
mn 如果b
设为1,那么b
计算见式(A.2): b
=(1/h一1)/1一p (A.2) 式中: h" 性状狭义遗传力的遗传方差比例 性状分子标记解释的遗传方差比例
-般利用多元回归方法捕获与QTL有连锁不平衡(linkagedisequilbrium，LD)的标记效应,累加 标记相关的所有QTL的加性效应值,得到分子净值
通过个体表型值与群体均值得到个体表型值的 离差值
对于多性状,可以用直接求和的方式,或者以各性状经济值加权求和的方式,合并不同性状的 选择指数,构建出一个综合选择指数
GB/40188一2021 附录 B 资料性附录 MA-BLUP模型及说明 MA-BLUP基本模型计算见式(B.1) y=Xb十Wa十iu十e .( B.1 式中 性状表型值向量 b的关联矩阵; -非遗传固定效应向量; w a的关联矩阵; 分子标记提供的前景遗传效应值 u的关联矩阵; -系谱信息提供的背景遗传值，即剩余多基因加性效应向量 个体随机残差向量
GB/T40188-2021畜禽分子标记辅助育种技术规程解析
一、背景介绍
畜禽育种是农业生产中极其重要的一个环节，而分子标记辅助育种技术则是现代畜禽育种中的新生力量，使得育种效率和精度都得到了很大提高。然而，由于畜禽分子标记辅助育种技术相对于传统育种技术来说较为复杂，因此需要相应的规范和标准来保证其应用的准确性和可靠性。
二、主要内容
GB/T40188-2021标准对畜禽分子标记辅助育种技术的应用做出了详细规定。该标准主要包括以下内容：
- 术语和定义：对畜禽分子标记辅助育种中常见的术语和定义进行了详细说明，便于理解和操作。
- 标记选择：明确了畜禽分子标记辅助育种实验中常用的标记类型、筛选方法等。
- 标记检测：规范了畜禽分子标记辅助育种实验中标记的检测方法，包括PCR反应、电泳分析、序列检测等。
- 基因型分析：介绍了畜禽分子标记辅助育种实验中常用的基因型分析方法，包括遗传距离计算、群体结构分析等。
- 育种效果评价：规范了畜禽分子标记辅助育种实验中对育种效果的评价方法，包括遗传参数估计、亲本选择策略等。
三、意义和应用
GB/T40188-2021标准的发布，对畜禽分子标记辅助育种技术的规范化和标准化具有重要意义。该标准规范了畜禽分子标记辅助育种实验中各个环节的操作方法和技术要求，可提高实验准确性和可靠性。同时，该标准也可作为科研工作者和实践者进行畜禽分子标记辅助育种研究和实践的参考。
四、结论
GB/T40188-2021标准的发布，对于促进畜禽分子标记辅助育种技术在我国的畜禽生产中的应用具有重要意义。该标准规范了畜禽分子标记辅助育种实验中的各个环节，为畜禽育种技术的进步提供了坚实保障。
